“江西省鄱阳湖流域农业资源与生态重点实验室”于2007年4月，江西农业大学国土资源与环境学院联合林学院、经济贸易学院，申请成立了“江西农业大学鄱阳湖流域农业与生态重点实验室”，2010年9月经江西省科技厅批准，在“江西农业大学鄱阳湖流域农业与生态重点实验室”的基础上，组建成立“江西省鄱阳湖流域农业生态工程技术研究中心”（赣科发财字[2010]161号），同时，组建了“南昌市鄱阳湖生态重点实验室”，2014年12月，通过江西省科技厅验收和批准，“江西省鄱阳湖流域农业生态工程技术研究中心”调整变更为“江西省鄱阳湖流域农业资源与生态重点实验室”（赣科发财字[2014]200号）。目前，实验室主任为江西农业大学校长赵小敏教授，学术委员会主任为赵其国院士，学术委员会副主任为傅伯杰院士和龚健雅院士。
　　实验室以鄱阳湖流域为研究区域，以农业资源合理高效利用和农业活动对流域生态环境影响机理为主线，以农业资源（水土肥料资源）和土地资源利用、流域生态环境过程、流域农业污染防控和流域生态经济为重点，以“湖泊—流域—资源”系统理念为指导，综合运用“3S”技术、生态工程技术和系统模拟技术，研究鄱阳湖流域农业资源利用、保护和生态安全，为江西省建设农业强省和国家生态文明试验区提供技术和智力支撑。
　　实验室立足于鄱阳湖区，放眼于鄱阳湖全流域，以农业生产对流域生态环境影响机理研究为主线，以生态农业、低碳农业、水文过程和农业生态经济为重点，以系统动态变化模拟为技术支持，以协调农业生产与生态环境保护，实现流域农业生产可持续发展为研究目标。研究主要包括：农业资源遥感与信息技术与应用、农业资源（土壤肥料资源）利用技术研究与示范、土地资源利用与整治技术研究与示范、生态环境过程与综合管理四个方面的内容。
　　实验室结合研究室和学科方向，以各相关学科带头人为核心，加强人才的培养和引进工作，逐步形成国内外有一定影响、老中青结合的研究团队。实验室人员由专职人员、兼职人员和流动人员组成，总人数已达60多人，其中专职人员22人、兼职人员12人、流动人员30多人（含博、硕研究生）。专兼职人员中，具有高级职称或具有博士学位的人员占总人员数的80%以上。已经培养博士研究生8名、硕士研究生30名。
　　实验室近三年来，研究团队出版论著3部，在国内外各级学术期刊上发表鄱阳湖相关研究论文100多篇，其中：被SCI和EI检索共12篇，中文核心期刊45篇；获得国家发明专利1项，软件著作权1项；获得全国农牧渔业丰收奖、农业技术推广成果二等奖1项，江西省社会科学优秀成果二等奖1项、三等奖1项，江西省科学技术进步二等奖1项,江西省科学技术进步三等奖1项；承办全国性学术会议2次，省级学术会议1次；共有4名研究人员出访美国、英国和加拿大；共承担各级各类课题60多项，其中主要的有46项，包括：国家级项目19项，省部级项目14项，重点横向研究项目13项，累计经费2157.4万元，并通过实施各类科研项目，实验室各研究团队受到了较好的锻炼，提高了科研综合实力。
　　“江西省鄱阳湖流域农业资源与生态重点实验室”将在鄱阳湖流域农业资源与生态研究领域大力开展应用基础研究和科技创新研究，统筹协调好农业生产与生态环境保护的关系，形成一批科技含量高、应用目标明确且具推广价值的科研成果，为合理利用农业资源、发展绿色农业、生态农业和江西省建设农业强省以及江西省建设生态文明示范区等提供科学依据和技术支撑。